В Богоявленский собор передана святыня – ковчег с мощами преподобного Нила Столобенского. Этот дар томичи получили от Тверской епархии.
Существует поверье, что Нил Столобенский является покровителем людей, занимающихся торговлей. Об этом святом известно, что он родился во второй половине XV века в Новгородской земле, после смерти родителей принял монашеский постриг с наречением имени Нил. Жил уединённо на острове Столбный и всё время проводил в молитвах.
Томские верующие могут помолиться святым мощам в Богоявленском соборе.